导弹，尤其是各类战术导弹，因为其射程远、隐蔽性好、突击性好等特点，一直被收容者联盟中央军事委员会高度重视。1992年，收容者联盟委托收容者联盟驻莫斯科专员、驻利亚德专员转运了一批红箭-73反坦克导弹、B611地对地弹道导弹，并以此为基础开始设计自己的导弹系统。
和各国导弹命名计划不同，收容者联盟的导弹命名统一采用“代号-型号”的格式命名，例如“寻光者-3K”、“长钉-9Z”等，字母的具体含义在文中详细展示。
对地导弹
对地导弹是收容者联盟最早发展出的一系列导弹。该系列导弹最早设计并列装的为“长钉”反坦克导弹，后期逐步列装了包括“寻光者”、“巡天”、“风暴”等多个导弹系列。
“长钉-1”反坦克导弹
“长钉-1”反坦克导弹于1999年完成设计验收，2000年开始列装部队，主要用于解决联盟反坦克能力严重不足的问题。该型导弹以红箭-73反坦克导弹为蓝本，提供了单兵携带型和载具携带型两种携带方式。该型导弹使用有线制导方式，使用铜线作为遥控媒介，由发射器、导弹、瞄准具三部分组成，发射器和瞄准具重量5公斤，导弹单发重量3公斤，有效观瞄距离为1.5公里，有效射程为1公里。为提高通用性，“长钉-1”采用了和红箭-73一样的观瞄设备和操作方式。“长钉-1”弹体长750毫米，直径65毫米，使用飞翼方式控制飞行姿态，提供了金属射流破甲战斗部和钢针次口径穿甲战斗部两种，末端速度可以达到320米每秒，静破甲能力600毫米。在此基础上，收容者联盟研制了使用云爆弹战斗部的“长钉-1B”攻坚导弹、使用杀爆弹的“长钉-1C”反人员导弹。该型导弹是收容者联盟设计的第一型导弹，此后通过改造得到了“长钉-2”和“长钉-3”系列，在射程与末端飞行能力上都得到了较好的提升。
“长钉-4”反坦克导弹
2007年，随着联合军事改革开始，收容者联盟接收了一批中国人民解放军设计的武器，收容者联盟各部门也开始加快和中国各界的交流，一批新的技术也开始引入收容者联盟。在基本理解了红外/雷达制导机制后，收容者联盟着手设计了“长钉-4”反坦克导弹。2012年3月，“长钉-4”完成设计验收，于2013年开始列装收容者联盟各部队。该型导弹长980毫米，采用一次性发射筒设计，直径75毫米，有效射程2公里。战斗能力上，“长钉-4”可以在1000米距离上实现静破甲能力800毫米的较好效果，对大部分三代主战坦克都有一定威胁性。“长钉-4”采用雷达制导方案，但仍然保留了有线制导接口，必要时可以用有线指导执行攻坚/反人员任务。在“长钉-4”基础上，收容者联盟工业部门改造了“长钉-4A”、“长钉-4B”两款反人员用导弹，并设计了“长钉-4L”完全雷达制导的版本。
“长钉-5”反坦克导弹
2027年，“长钉-5”系列投入使用。该系列导弹是第一款彻底脱离“人员中心”设计思想的反坦克导弹，该型导弹标准长度1300毫米，重量160公斤，使用激光/红外复合制导，直径65毫米，射程15公里，采用串联破甲战斗部，可以安装在直升机、无人机或装甲步兵车上执行反坦克任务。穿甲能力方面，“长钉-5”能够在五公里左右距离上实现静破甲能力1300毫米、动破甲能力1000毫米，并且能够通过跨射方式实现灌顶打击，足够对大部分装甲车辆产生致命威胁。“长钉-5”是收容者联盟自主研制的第一型自主制导、不依靠单兵携带的反坦克导弹，但是为了提升步兵反坦克能力，后续仍然设计了轻量型的“长钉-5Q”单兵式反坦克导弹，主要在连一级配发，重量20公斤，射程5~6公里。不过，随着单兵火箭筒和连排一级伴随火力的性能大幅提升，单兵反坦克导弹逐渐成为了落后的武器，并最终退出现役。
“长钉-12”反坦克导弹
收容者联盟目前主要列装的反坦克导弹，于2203年开始列装各部队。该型导弹已经完全不再配发普通步兵，主要用于直升机或小型无人机携带。“长钉-12”弹长1.2米，弹径80毫米，射程20公里，重量160公斤，采用激光和/或雷达-红外复合式自主制导方式，具备了较好的射后不管能力。
“寻光者-1”反辐射导弹
“寻光者”系列于1999年开始设计，2002年完成设计验收，是收容者联盟另一款较早开始设计的导弹。该型导弹最早为单兵配装版本，用于为无法呼叫我炮兵或空军火力的敌后战斗员提供反雷达能力。“寻光者-1”长度750毫米，直径55毫米，重量6.5公斤，射程5公里。该型导弹采用和89式单兵火箭筒一样的发射系统，发射时发射员需要将发射筒面向打击目标抬高45-60º，发射后导弹内部的下视雷达会自动搜寻飞行轨迹上的辐射源。“寻光者-1”是收容者联盟唯一一款为单兵配发的反辐射导弹，事实上使用反馈和效果普遍很差。由于导引头安装的是简易的下视雷达，“寻光者-1”仅能捕捉大功率雷达（例如敌方指挥所、大型防空阵地等），并且存在着抗干扰能力差、辐射源消失后无法追踪等问题，更多的战斗人员选择重量较轻的55毫米单兵火箭弹抵近射击，而不是“寻光者-1”。2006年，收容者联盟研发了“寻光者-1A”型反辐射导弹，一定程度上解决了抗干扰能力差、辐射源功率要求高的问题。
“寻光者-2”反辐射导弹
2007年联合军事改革全面展开后，收容者联盟接收了来自中国人民解放军的一系列新技术。在此基础上，2026年，“寻光者-2”首次亮相。该型导弹重量350公斤，长度3.1米，直径85毫米，采用导弹背部的飞翼提供巡航升力，最大巡航高度8000米，最大射程可以达到280公里。制导能力方面，“寻光者-2”采用主动制导方式，在飞行过程中不开机，采用惯性制导和地形信息确认航行方向，在距离目的地10公里左右时雷达开机，开机后将自动搜索并追踪距离最近的辐射源。虽然“寻光者-2”仍然不具备较好的关机后追踪能力，但是通过末端加速和大装药战斗部仍然能够避免一部分脱锁情况。整体来说，“寻光者-2”是收容者联盟第一款成功的反辐射导弹，也是第一款被大规模应用在各类对地打击场景当中，不过更多打击目标为地方固定目标（对敌方机动目标打击时有概率仅瘫痪机动目标）。
“寻光者-6”反辐射导弹
随着对“水滴”相关技术的研究，收容者联盟逐渐掌握了变频反射材料的技术。在此基础上，具备强隐身能力的“寻光者-6”于2093年服役。该型导弹长5.5米，直径50毫米，重量400公斤，采用可抛弃的滑翔翼设计，最大射程400公里。该型导弹在15000米高度巡航时，速度可以达到600公里每小时。除此之外，“寻光者-6”首次应用了联盟变频反射材料，这种材料能够将微波雷达频率以线性方式降低后反射，从而导致敌雷达系统全面失效。通常情况下，“寻光者-6”的最大雷达可见距离只有650米，正面雷达可见距离仅不足100米，高空飞行的导弹可以直接掠过敌防空阵地而不被发现。在“寻光者-6”上，联盟首次使用了末端光电制导系统，通过变频反射材料的受光频谱确定敌雷达位置，能够在敌雷达关机后继续追踪最多3公里，误差不超过30厘米。该型导弹一经列装就大受欢迎，并在第三次世界大战中多次用于打击敌纵深目标。
“寻光者-11”反辐射导弹
目前收容者联盟主要使用的反辐射导弹。该型导弹主要分为普通版和Q版本，普通版重400公斤，射程800公里，巡航高度18000米，最大飞行速度800公里每小时，主要用于防区外打击。“寻光者-11Q”重量2-3公斤，射程3000米，巡航高度10000米，最大飞行速度400米每秒，主要用于列装“蜂鸟”等小型无人机。
“巡天-1”巡航导弹
收容者联盟对巡航导弹的研制开始时间很晚。2073年，时任收容者联盟安全部部长、收容者联盟中央军事委员会委员丁兴华向时任收容者联盟中央军事委员会主席徐宏远提议借助无人机技术发展巡航导弹。此提议很快得到了收容者联盟中央军事委员会的通过，并于2075年决定开始“巡天-1”巡航导弹研究工作。
2093年，“巡天-1KD”空地巡航导弹服役。该型导弹长5.5米，直径65毫米，射程600公里，飞行速度0.5马赫，最低飞行高度为15米，采用卫星制导与惯性制导方案作为中段制导。由于该型导弹采用“寻光者-5”系列反辐射雷达作为末端制导，因此在实际部署当中通常也被称作“寻光者-5KD”。该型导弹是收容者联盟第一型巡航导弹，在第三次世界大战当中发挥了不小的作用。
“巡天-7”巡航导弹
“巡天-7”巡航导弹系列是收容者联盟目前服役的主力巡航导弹，分为KD（空-地）型、AKD（岸-空-地）、AKJ（岸-空-舰）三大类，AKJ类型参数详见“对舰导弹”栏目，这里主要内容为KD和AKD型。
KD/AKD型通常统称为K/AKD型，采用同一弹体设计，唯一区别是空基会额外添加适配于战机挂载架的挂载装置，发射后会自动弹射分离。“巡天-7K/AKD”型巡航导弹长7.5米，直径850毫米，射程3000公里，飞行速度0.8马赫，最低飞行高度5米，采用反辐射雷达/红外-雷达/卫星三类制导方案，末端精度0.5米。
“风暴”高超音速导弹
“风暴”高超音速导弹，于21世纪后半叶开始研究，并在第三次世界大战中首次得到大批量使用。
2066年，“风暴-1”开始列装收容者联盟火箭军。该型导弹采用双锥体弹头设计，重量7.5吨，战斗部重1吨，射程1200公里，巡航速度6马赫，巡航高度60公里。该型导弹能够搭载常规战斗部或集束战斗部，并允许使用弹载雷达获取敌防空火力位置以执行机动规避。
2130年，“风暴-2”开始列装部队。该型导弹采用乘波体结构设计，重量11.2吨，战斗部重1.5吨，射程1500-1800公里，巡航速度12马赫，巡航高度60公里。该型导弹属于核常兼备型弹头，允许携带包括核弹和崩坏裂变弹在内的战斗部，并采用收容者联盟设计的特殊热学材料，能够在巡航和末端大幅度降低热学效应，降低敌方捕获几率并增大末端制导精确度。
目前，收容者联盟主要列装的是“风暴-5”系列导弹，该型导弹分为多种不同结构设计，并实现了不同的射程范围：
“风暴-5A”：采用冲压发动机构型设计，射程1800-2000公里，巡航速度25马赫，巡航高度75公里，使用常规弹头，支持惯性制导、卫星/星光制导、红外制导或数据链指令制导。
“风暴-5B”：采用双锥体弹头设计，射程1500-1800公里，巡航速度18马赫，使用重型钻地弹头。
“风暴-5C”：采用乘波体弹头设计，射程2500公里，巡航速度20马赫，允许携带核弹，战斗部重量2～2.5吨。
“风暴-5D”：采用吸气式发动机设计，射程2200公里，巡航速度15马赫，允许携带核弹，战斗部推进级采用液体发动机工作。
“风暴-5M”：采用“乘波体战斗部-吸气式发动机”融合设计，射程3000公里，巡航速度25马赫，战斗部重量2吨。
对空导弹
“云镝-0”地空导弹
“云镝-0”地空导弹是收容者联盟中央集团军于中国人民解放军处接收的两套红旗15防空导弹系统的改装版本。该型改装仅加装了联盟自主设计的处理器系统，使其能够兼容联盟内部的数据链系统。
“云镝-1”地空导弹
“云镝-1”地空导弹是收容者联盟在“云镝-0”基础上设计的一型地空导弹，改造设计时接受了中国兵器集团的大力协助。该型导弹于2009年完成设计验收，2009年末开始列装各部队。“云镝-1”射高10~25公里，射程55公里，最大机动过载30G，采用固定发射阵地方式部署，每个发射阵地配套一台LR-1型米波雷达和4组垂直发射架，单次最大供弹量64发。该型导弹原计划部署期为10年，但是仅在上海、黑龙江等少数几个基站进行了部署，随后迅速被“云镝-2”导弹代替。
“云镝-2”要地防空导弹
2012年华东特大空情后，“降临者”对“云镝”系列现有性能表示了极大不满，并要求根据空情出现的状况重新设计一款地空导弹。在此基础上，“云镝-2”要地防空导弹系统于2014年8月完成验收，并于2015年初开始列装部队。该型地空导弹采用固定发射阵地部署方式，重量1300公斤，射高5-75公里，最大射程65公里，采用红外/雷达复合导引头和半主动制导模式，弹头部位携带一个装药量150公斤的连续杆战斗部和一个穿甲深度750毫米的金属射流破甲战斗部，能够对部分重装甲空中单位予以沉重打击。2017年对三体自卫反击战中，“云镝-2”发挥了不可忽视的作用，击落了敌多艘突击型飞船，并通过KJ-500C型多用途预警机欺骗引导方式击沉美国第七舰队蓝岭号旗舰、里根号航母。
“云镝-13”系列地空导弹
“云镝-13”系列地空导弹为收容者联盟目前服役的主要地空导弹系列，具体分为如下型号：
“云镝-13A”野战防空导弹：弹长1.3米，弹径200毫米，射程75公里，射高3~15公里，最大飞行速度1.2马赫，最大过载40G，采用导弹发射车方式部署，可以由一台AHQ-7型对空雷达为多台导弹车提供制导信息，也可以通过数据链由制空战机/预警机提供制导信息。
“云镝-13Y”要地防空导弹：弹长1.6米，弹径650毫米，射程300公里，射高6~40公里，最大飞行速度3马赫，最大过载60G，采用固定阵地方式部署，通过YHQ-9型大型防空雷达进行制导。
“云镝-13H”舰载防空导弹：弹长3米，弹径420毫米，射程550~600公里，射高3米~100公里，最大飞行速度8马赫，最大过载100G，通过舰载8联装发射单元/垂直发射单元部署，允许舰载雷达或舰载机数据链提供制导信息。
“云镝-13L”单兵防空导弹：弹长1.2米，弹径45毫米，射高3000米，射程15公里，使用雷达/红外主动制导方式，通过“山猫”系列全地形车部署。
“光矢-1”空空导弹
“光矢”系列空空导弹于2012年开始研究。2012年华东特大空情后，收容者联盟中央军事委员会下令研制空空导弹，要求不可逃逸范围不小于40公里，最大速度不小于3马赫，以便于对空打击或拦截外空武器。
“光矢-1”空空导弹于2015年完成技术验收，2016年开始服役。该型导弹长4.5米，直径300毫米，采用红外/雷达复合制导的半主动制导方式，射程180公里，不可逃逸范围60公里。由于该型导弹在相当程度上借鉴了解放军“霹雳-15”型空空导弹，因此也被戏称为“霹雳15L”。该型导弹服役后就受到收容者联盟空军的赞赏，并在2017上海决战中取得了不小的战果。
“光矢-2”空空导弹
“光矢-2”空空导弹在“光矢-1”基础上进行研发，于2019年完成技术验证，2023年初列装部队。该型导弹长4.8米，直径240毫米，采用红外/雷达复合制导的主动制导方式和三段脉冲+燃气舵的动力方式，射程180公里，不可逃逸范围85公里，最大机动过载70G，末端最小速度1.2马赫。该型导弹是收容者联盟服役时间最长、生产数量最多的导弹，生产的库存直到第三次世界大战后期才基本全部消耗。
“光矢-9”空空导弹
“光矢-9”空空导弹是收容者联盟目前服役的主力空空导弹系列，分为“光矢-9”远程空空导弹、“光矢-9Z”中距空空导弹、“光矢-9X”近程空空导弹三大种类。具体参数如下：
“光矢-9”远程空空导弹：长6.5米，直径450毫米，使用“猎犬-2”反辐射雷达被动制导，射程400公里，反辐射雷达对敌方预警机最大截获范围为300公里，敌机最大可截获范围0.75公里，末端速度5马赫，末端最大机动过载45G，主要用于打击敌战区/后方高价值飞行器。
“光矢-9Z”中距空空导弹：长5米，直径300毫米，使用有源相控阵雷达/反辐射雷达复合制导方案，射程240公里，不可逃逸范围120公里，最大机动过载60G，末端最小速度3马赫。
“光矢-9X”近程空空导弹：长3.5米，直径300毫米，使用红外/有源相控阵雷达复合制导，射程120公里，不可逃逸范围80公里，最大机动过载75G，最大离轴发射角度为210度。
对舰导弹
“巡天-7K/A/JKJ”反舰巡航导弹
“巡天-7K/A/JKJ”反舰巡航导弹是收容者联盟目前现役的主要反舰巡航导弹（反舰导弹包括“巡天”、“复仇者”、“风暴”三个类型）。“巡天-7”反舰巡航导弹长8.8米，直径420毫米，射程1000公里，巡航速度2马赫，末端速度4马赫，巡航高度4米。该型导弹采用反辐射雷达/卫星-雷达制导复合方案，并通过多类型数据链实现连续定向制导。
“狂涛-4”反舰弹道导弹
“狂涛-4”反舰弹道导弹是收容者联盟目前现役的主要反舰弹道导弹，分为海基型和陆基型。该系列导弹覆盖了联盟自研的线性变频材料，通过再入时的高温为导弹的末端制导组件和风帽硬化组件充能。此外，两种型号的共同点是：都采用了大当量弹头和高强度硬质材料，统一采用“过穿甲+水下定向爆破”的弹头控制方式，并且全系列仅提供最高1600公里射程。
“狂涛-4”陆基型：弹长24米，弹径2.8米，总重65吨（预装两级固体燃料52吨+末端固体推进剂3吨），战斗部重1.6吨，安装1.2吨CL-75高能炸药，末端速度约为27马赫。该型导弹对C160钨钢混凝土的穿深约为85米，特殊情况下也可以用于打击地方深层工事；在命中舰体后，该型导弹将迅速穿透舰体，并在目标舰龙骨下方约3~5米引爆，造成舰体洞穿和龙骨断裂。
“狂涛-4”海基型：弹长15米，弹径1.2米，总重42吨（预装两级固体燃料35吨），战斗部重1.2吨，安装800公斤CL-80高能炸药，末端速度约为25马赫。该型导弹对C160钨钢混凝土的穿深约为70米，攻击方式与陆基型一致。
弹道导弹
“复仇者”弹道导弹
“复仇者”弹道导弹，是收容者联盟自主设计的一型战略威慑武器。目前，“复仇者”弹道导弹各型号都有大量服役于收容者联盟战略武器部队，射程从800公里到50000公里，最大当量可达8000万吨TNT，并有部分安装了崩坏裂变弹，其中“复仇者-3”型可由导弹发射车携带，“复仇者-6”型可由战略核潜艇携带。由于保密原因，此处不便透露更多信息。